Coronavirus, tutti i tipi di test diagnostici esistenti: dal più usato al meno conosciuto - Open

2021-12-14 20:30:57 By : Ms. cindy lin

Cosa intendiamo quando parliamo di assorbenti interni? Perché in certi casi preferiamo l'analisi sierologica? Analizziamo i pro e i contro

Si avvicina il giorno della riapertura delle scuole. C'è da chiedersi quanto sia opportuno farlo e come effettuare test su bambini e insegnanti, questi ultimi attualmente nell'occhio del ciclone per il presunto rifiuto di molti di loro di sottoporsi allo screening. Il nuovo Coronavirus suscita polemiche anche sull'efficacia dei tamponi stessi, a cui si aggiunge la confusione sulle varie tipologie di test diagnostici. In questa analisi elenchiamo i test più utilizzati e meno conosciuti. La loro efficacia va considerata in relazione allo scopo per cui sono utilizzati. Alcuni sono utili per accertare se sei malato o meno, altri si sono rivelati molto utili per la ricerca scientifica e per monitorare la diffusione del virus.

SARS-CoV2 è un virus a RNA a filamento singolo. Fa parte della famiglia dei beta-coronavirus, tipica di diverse specie di pipistrelli che ne rappresentano l'ospite serbatoio, mentre diversi elementi portano a considerare il pangolino - ampiamente utilizzato nella medicina tradizionale cinese - come l'amplificatore ospite, quindi intermediario dello spillover da animali alle persone. Tuttavia, l'ipotesi del pangolino rimane oggetto di dibattito.

Il virus è emerso a dicembre 2019, ma ci sono elementi che potrebbero retrodatare la sua comparsa a novembre. È stato isolato per la prima volta in Cina e il suo genoma è pubblico da gennaio 2020. Codifica 10 geni, di cui due terzi sono dedicati alla RNA polimerasi, l'enzima che utilizza il Coronavirus per moltiplicarsi all'interno delle nostre cellule. Il capside, o l'involucro che contiene l'RNA, è cosparso di una corona di glicoproteine ​​Spike (S). 

Questi sono gli antigeni, che si legano ai recettori ACE2 delle nostre cellule, soprattutto quelle dei polmoni. Recenti studi sulla mutazione D614G del genoma virale suggeriscono la possibilità che abbia reso il patogeno maggiormente capace di legarsi all'ACE2, ma senza che questo comprometta il nostro organismo nel riconoscerlo.

Quindi Spike (S) è il bersaglio principale delle cellule del sistema immunitario. Diverse strategie farmacologiche mirano a sabotare l'RNA polimerasi; gran parte della ricerca per un vaccino, invece, sperimenta vettori virali che veicolano un frammento di RNA messaggero, per la sola produzione di antigeni. Altri studi cercano di capire quali condizioni potrebbero favorire il legame del virus ai recettori bersaglio.

Esistono due anticorpi specifici del sistema immunitario che ci interessano per il loro ruolo nella risposta all'infezione, determinando l'immunità al virus e la sua durata: le immunoglobuline M e G (IgM e IgG), prodotte dai linfociti B. Le IgM agiscono riconoscendo immediatamente il patogeno, le IgG arrivano più tardi e con la loro permanenza determinano la durata dell'immunità.

Capire quanto dura la convalescenza e la possibilità di essere positivi senza mostrare sintomi, rende plausibile che qualcuno sembri ammalarsi di nuovo, mentre la spiegazione più probabile può risiedere nelle nostre difficoltà nel comprendere le dinamiche con cui avviene la risposta anticorpale.

Secondo un recente caso clinico, un cittadino di Hong Kong sembra essersi ammalato per la seconda volta in circa quattro mesi. Ma in tutto conosciamo forse cinque casi simili nel mondo, quindi sarebbe irresponsabile sostenere che sia stata dimostrata una regola che vale per tutti.

In generale, i casi gravi di Covid-19 non sembrano dipendere da una maggiore densità di ACE2 (che vediamo ad esempio nei bambini), ma dalla produzione di citochine in eccesso. Questa reazione eccessiva potrebbe essere promossa sia dai linfociti B che dalla linea di difesa cellulo-mediata costituita dai linfociti T. Le ragioni intrinseche di questa "tempesta di citochine" non sono ancora del tutto comprese.

Questa immunità cellulare interviene in modo non specifico, e spiegherebbe quindi anche la presenza di asintomatici, in quanto potrebbero essere stati ereditati da precedenti infezioni, dovute ai comuni Coronavirus, responsabili dei raffreddori. Per ulteriori approfondimenti vi rimandiamo al nostro precedente articolo, di cui riportiamo uno stralcio:

Il sistema immunitario deve prima riconoscere l'antigene, utilizzato dalla SARS-CoV2 (la glicoproteina Spike), per infettare le cellule. I linfociti B (cellule B) poi producono anticorpi specifici (immunoglobuline M e G); ma intervengono anche i linfociti T (cellule T), questi possono anche determinare la presenza di cellule B, e macrofagi, capaci di fagocitare i patogeni. L'immunità cellulo-mediata in generale può coinvolgere anche la presenza di cellule NK (natural killer), che attaccano le cellule infette, uccidendole o mandandole in apoptosi (morte programmata). In seguito a questi processi si producono citochine, che coordinano la risposta immunitaria attirando nuovi linfociti, quindi si crea infiammazione. In alcuni pazienti si possono generare ulteriori danni a causa dell'eccessiva produzione di queste sostanze, tristemente nota come tempesta di citochine, che caratterizza le forme gravi di Covid-19.

Si ritiene probabile, ad esempio, che una reinfezione non porti a casi gravi - forse proprio a causa della permanenza dei linfociti T - mentre non è escluso che rimanga infettiva. In assenza di un vaccino sicuro ed efficace, non ci resta che monitorare suscettibili, positivi e guariti, come previsto dal modello epidemiologico SIR, al fine di attuare misure di tracciamento dei contatti e distanziamento sociale.

Il tracciamento dei contatti, ovvero il tracciamento della diffusione del virus in una popolazione, si basa fondamentalmente sull'identificazione dei positivi. Questo ha una valenza sociale, meglio rappresentata - in Italia - dalla buona abitudine di tenere installata l'App Immune sul proprio telefonino. Ma la positività individuale non significa automaticamente essere contagiosi.

In merito alle discussioni in merito alla riapertura delle scuole e alle polemiche sui docenti che si sarebbero rifiutati di sostenere i test, la divulgatrice Roberta Villa è recentemente intervenuta su Facebook, analizzando la loro scelta, anche per quello che abbiamo appena specificato.

Interrompo un attimo la mia breve vacanza per far luce sui test sierologici alle maestre, che per il...

Comprendere il significato dei test diagnostici è importante per l'individuo anche per capire se è attualmente in grado di diffondere il virus o meno, perché - magari asintomatico - ha superato la malattia senza rendersene conto, non avendo traccia di virioni (singole particelle virali ). attivo. Altri possono essere presintomatici.

I test possono rilevare anticorpi, tracce genomiche del virus o dei suoi antigeni. Semplificando ai fini della comprensione, potremmo dire che se identifichiamo soprattutto IgM, significa che c'è una malattia in atto; se troviamo solo IgG, significa che c'è stata un'immunizzazione. Trovare tracce del virus attraverso l'RNA ci dice molto sulla sua diffusione, ma poco sulla capacità dell'individuo di essere ancora infettivo.

Più problematiche sono le analisi basate sulla presenza di antigeni, perché non è certo che tutti gli infetti ne abbiano tracce nelle prime vie respiratorie. Ogni test ha i suoi pro e contro, possono produrre più falsi negativi e/o positivi, quindi vanno ripetuti e confrontati con altri.

Quindi parallelamente a Villa segnaliamo anche il post su Facebook del professor Enrico Bucci, dove spiega l'utilità sociale dei test ai docenti.

TEST SIEROLOGICI E INSEGNANTE Molti giustamente scrivono che il test sierologico non serve per rivelare se qualcuno...

Sulle varie prove, per chi ha già una preparazione di base consigliamo un articolo di iScience del 25 luglio 2020, dove vengono analizzate tutte le tipologie conosciute e i relativi pro e contro.

Il test RT-PCR fa parte di una tipologia finalizzata all'amplificazione degli acidi nucleici (NAAT), ovvero le macromolecole che immagazzinano e codificano l'informazione genetica (DNA e RNA). In questo modo è stato possibile isolare il virus, facendolo così moltiplicare in speciali colture cellulari. Trovare tracce di SARS-CoV2 attraverso un NAAT è attualmente il miglior metodo possibile per accertare il Covid-19, anche se i sintomi sono lievi o assenti.

Il modo in cui si ottiene il campione da analizzare determina l'affidabilità delle prove. Per rilevare l'RNA virale questi possono provenire dalle vie respiratorie superiori e inferiori, attraverso appositi tamponi, che possono essere nasofaringei, orofaringei, prelevati dall'espettorato, aspirati dalle basse vie respiratorie e lavaggio broncoalveolare. Comprensibilmente, sono meno popolari nei media, ma ci sono anche tamponi anali, urina e feci. Gli occhi sono anche un potenziale gateway per il virus ed è possibile tamponare lacrime ed escrezioni congiuntivali.

I tamponi più consigliati sono quelli che interessano le prime vie respiratorie, in particolare nasofaringeo e orofaringeo, ma con più raccomandazioni per i primi. Generalmente si utilizzano imbottiture in fibra sintetica; sebbene assomiglino al cotone, generalmente utilizzato per l'igiene delle nostre orecchie, non sono la stessa cosa. Le aste che reggono questi dispositivi dovrebbero essere sempre in plastica, altri materiali potrebbero infatti compromettere l'affidabilità dei test, soprattutto quelli PCR.

Data la grande richiesta, questi dispositivi rischiano sempre di mancare, motivo per cui anche in questo caso si vedono i benefici dell'industria 4.0, attraverso la produzione con stampanti 3D, come avevamo potuto dimostrare nel campo delle mascherine chirurgiche, e altri dispositivi. indispensabile nelle unità di terapia intensiva. 

Sebbene il test stesso non dovrebbe richiedere generalmente più di un paio d'ore, dovrebbe essere contato anche il tempo dal tampone al test effettivo. Di solito esistono dalle 24 alle 72 ore. Tutto dipende da come è organizzato il trasporto e la conservazione dei campioni. In caso di ritardi vanno congelati a -70°C. Negli Stati Uniti il ​​"viral transport medium", cioè la sostanza che permette la conservazione dei virioni, è costituito da siero bovino in soluzione salina: il cosiddetta "soluzione salina bilanciata di Hanks".

Se rilevare tracce di RNA virale non garantisce che il virus sia ancora attivo, è possibile trovare tracce della risposta immunitaria attraverso vari test che non prevedono il tampone, cioè quelli sierologici; oppure, supponendo che le glicoproteine ​​Spike (S) possano essere identificate quando il Coronavirus è attivo, è possibile effettuare quelle antigeniche, che invece richiedono il tampone.

Generalmente, devono rilevare la presenza di immunoglibuline, oppure questo può essere dedotto esaminando le cellule in coltura, o rilevando la presenza di antigeni virali.

Foto di copertina: Ansa / Filippo Venezia | Il personale sanitario sottopone gli insegnanti a test rapidi per il coronavirus alla fiera di Brescia, 24 agosto 2020.

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